Dzieli się na dwie grupy: patologię ogólną i patologię układową. Patologia ogólna zajmuje się nieprawidłowymi bodźcami komórek i tkanek, które stanowią podstawową przyczynę wszystkich chorób. Patologia układowa bada określone reakcje określonych narządów i tkanek na określony bodziec.

W laboratoriach patologicznych szczegółowo badane są wymazy szyjki macicy, aspiracje cienkoigłowe pod kontrolą ultrasonografii lub tomografii komputerowej, biopsje Tru-Cut, małe biopsje, biopsje wycięciowe i materiały chirurgiczne. Do wymazów szyjki macicy stosuje się technikę wymazu ciekłego.

Podczas badania materiałów biopsji i chirurgicznych, szczególnie w przypadkach guzów, zaleca się stosowanie zaawansowanych technik barwienia, takich jak histochemia i immunohistochemia.

Ponadto, badanie sekcji zamrożonych jest wykonywane w trakcie operacji wewnętrznej w celu ustalenia diagnozy w ciągu 15 do 30 minut, jeśli jest to zlecane.